宜宾市疾病预防控制中心全球流行病学情报摘抄
2023年04期 2023年01月28日
标题：SARS-CoV-2 Omicron 再感染病例不断增加，表明丹麦新冠后免疫力无效
日期：2022 年 12 月 13 日
来源：
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.09.13.22279912v1
https://www.news-medical.net/news/20220920/In-Denmark-Omicron-reinfections-reveal-ineffective-post-COVID-19-immunity.aspx
关键字：COVID
在最近发布到medRxiv * 预印本服务器的一项研究中，研究人员调查了丹麦的 SARS-CoV-2 变异再感染病例。
SARS-CoV-2 的进化导致出现了多种令人担忧的变体 (VOC)，这些变体具有更高的传染性和免疫逃避性，例如 Omicron，导致 SARS-CoV-2 再感染病例激增，并给全球 COVID-19 缓解带来困难。研究调查了 SARS-CoV-2 再感染频率，但仅限于逆转录酶聚合物链反应 (RT-PCR) 分析数据，其中未指定 SARS-CoV-2 Pango 谱系。此外，基因组测序报告通常分为初次感染或再感染，但个人的初次感染和再感染的下一代测序 (NGS) 数据很少同时报告。
*重要提示： medRxiv发表的初步科学报告未经同行评审，因此不应被视为结论性结论、指导临床实践/健康相关行为或视为既定信息。
关于研究
在本研究中，研究人员通过整合从丹麦 SARS-CoV-2 阳性个体获得的序列的 RT-PCR 分析和下一代基因组测序 (NGS) 分析以及 GISAID（全球禽流感数据共享倡议）数据库，根据变体对 SARS-CoV-2 再感染进行了表征。
分析了居住在丹麦的同一个人的原发性 SARS-CoV-2 感染和再感染的 NGS 数据和临床元数据。2020 年 3 月 1 日至 2022 年 8 月 28 日期间，共有 21,708 条再感染记录，其中包含有关原发性 SARS-CoV-2 感染和再感染的样本采集日期的数据。
该团队将临床 SARS-CoV-2 元数据记录为初次感染和后续感染的时间点，以测量初次感染和后续感染之间的持续时间。此外，还提供了原发感染和再感染的 RT-PCR 分析结果和 NGS 分析结果。
该团队排除了 70 个具有相同 Pango 谱系的病例条目（<总病例的 1%）（n=70），这些病例属于原发性感染和再感染，因为这些病例可能代表未解决的 SARS-CoV-2 感染，而不是再感染。此外，由于序列水平较低，Beta、Gamma 和“其他”（没有普遍接受的 Pango 命名法）VOC 数据也被排除在外。
再感染病例按变异和亚变异进行分层。访问了 GISAID 数据库以获取两个文件：一组文件包含 >1200 万个 SARS-CoV-2 序列的当前元数据，第二组文件仅包含记录了两次相关 SARS-CoV-2 感染的丹麦居民的筛选元数据文件。
结果
据报道，Omicron 的初次感染和再感染（即 Omicron-Omicron 感染）发生的时间比非 Omicron-Omicron 感染短（甚至在三周内，平均 22 周）。Omicron 初次感染后十周内再感染 Omicron 的病例主要报告为 BA.1 和 BA.2。
在使用任何 VOC 进行初次感染后，使用 Omicron 的再感染频率显著升高（25%，N=1875）。未报告由 Alpha VOC 引起的再感染病例，而 Delta VOC 导致 2.3%（n=169）的病例再感染。使用 Omicron 之前，自然感染引起的免疫力估计值超过 90%，但在三到四个月内降至 10% 以下。
在 Delta 诱发的原发性感染者中，因 Delta 变异株而导致的再感染率 <1% (n=18)，但因 Omicron 变异株而导致的再感染率为 41% (n=3060 例)。此外，除 Omicron (4.6%，n=340) 外，因相同 VOC 但亚变异株不同的再感染率仅为 0.3% (n=24)。自 2020 年 3 月以来再感染的个体中有 93% 是因 Omicron 变异株而导致的，这表明最初感染武汉-Hu-1 毒株、Alpha VOC 或 Delta VOC 变异株的 SARS-CoV-2 无法提供足够的免疫保护以防止再感染，尤其是对于 Omicron 再感染。
在由 Omicron BA.1、BA.2 和 BA.5 引起的原发性 SARS-CoV-2 感染病例中，分别有 62% (n=211)、20% (n=68) 和 30% (n=102) 报告了 Omicron 再感染。原发性 BA.2 感染者的 Omicron BA.5 亚变种 (26%, n=89) 再感染频率较高 (38%, n=129)。研究结果表明，尽管三种 Omicron 亚变种的 SARS-CoV-2 刺突 (S) 蛋白相似，但 Omicron 亚变种之间的差异足以阻止 Omicron BA.1/2 感染诱导的 nAbs（中和抗体）与 Omicron BA.5 S 结合。
结论
研究结果显示，大多数 SARS-CoV-2 再感染病例都是由 Omicron 引起的。在原发性 Omicron 感染者中，Omicron 再感染发生在很短的时间内，最短只有三周。研究结果表明，非 Omicron VOC 的原发性感染不足以提供免疫保护来防止 Omicron 再感染。
此外，研究结果还强调了 Omicron 的传染性和免疫逃避性，以及需要更新 SARS-CoV-2 疫苗、持续进行 SARS-CoV-2 监测和 SARS-CoV-2 进化评估，以指导改善全球公共卫生的政策制定。此外，该分析强调需要分析个体层面的 NGS 数据，以提供 SARS-CoV-2 再感染风险的精确估计。
编译：健康教育科 严亚丁
